雇用主は年間を通じ、給与と賞与のたびに、最終的な税額を概算するにすぎない税額表を用いて所得税を源泉徴収します。11月から12月にかけて、従業員は扶養親族、生命保険料と地震保険料、個人年金の掛金、住宅ローンの借入金残高を申告する書類を提出します。雇用主はこれをもとに年間の実際の税額を計算し、その年の最後の給与で調整します。通常は還付となります。大半の従業員にとって、これで納税義務は完了します。
年末調整は雇用主の法的義務であり、好意で行うものではありません。対象は、その雇用主に扶養控除等申告書を提出し、年間の給与収入が2,000万円以下の従業員です。それを超える収入がある人、不動産収入や海外の投資収益など相当額の他の所得がある人、医療費控除や寄附金控除を受けたい人は、2月から3月に自ら確定申告を行います。
2026年分の年末調整には、通常とは異なる手順が加わります。2026年度税制改正により2026年分の基礎控除と給与所得控除の最低保障額が引き上げられ、給与所得者の所得税の課税最低限は178万円となりましたが、この改正は2026年12月1日からの施行でした。1月から11月までの源泉徴収税額は改正前のルールで計算されているため、その差額は12月の年末調整で精算されます。
外資系企業にとってのポイント
- 給与計算の体制が対応できなければならない。 グローバルの給与計算サービスを利用する小規模な日本子会社は、書類の処理を含め、日本の年末調整を正しく実施できる業者を選ぶ必要があります。
- 幹部採用者は通常、自ら確定申告する。 2,000万円を超える人や、外国の親会社から株式報酬を受ける人の多くは個人で申告します。報酬パッケージに税務アドバイスの費用を含めることを検討しましょう。
- 退職者の扱いは異なる。 年の途中で退職した従業員は前の雇用主では年末調整されず、次の雇用主での年末調整か、確定申告で精算します。
- 2026年は12月の還付額が大きくなる見込み。 控除の改正により、今年12月には多くの従業員がまとまった還付を受けることになります。
出典
- 所得税法第190条、第194条、第121条
- 国税庁、年末調整に関する案内、ならびに令和7年度及び令和8年度税制改正に関する案内