日本の雇用主はすべて源泉徴収義務者です。給与支払日ごとに、社会保険料控除後の給与額と申告された扶養親族の数に応じた月額表を使って、給与から所得税を差し引きます。賞与については別の算出率の表で源泉徴収します。ある月に徴収した税額は翌月10日までに税務署に納付しなければなりません。従業員が10人未満の事業主は、申請により年2回の納付とすることができます（納期の特例）。
源泉徴収は、個人の専門家への報酬や役員報酬など、給与計算以外の一部の支払いにも適用されます。非居住者については、国内源泉の給与に対して原則として一律20.42%で源泉徴収されます。2013年以降、すべての税率に復興特別所得税（所得税額の2.1%の上乗せ）が含まれています。2027年1月からはこれが1.1%に引き下げられ、新たに1%の防衛特別所得税が加わり、復興特別所得税の期間は2047年末まで延長されます。上乗せ分の合計は2.1%のままですが、期間が10年長くなります。
年が明けると、雇用主は1月31日までに各従業員に源泉徴収票を交付し、税務署に写しを提出し、市区町村に給与支払報告書を提出します。源泉徴収票は日本における標準的な所得の証明です。
外資系企業にとってのポイント
- 源泉徴収票の提出を求める。 候補者の実際の給与を示す最も確実な証拠です。内定段階で提出を求めるのは日本では通常の慣行であり、「総報酬」の意味をめぐる食い違いの大半はこれで解消します。
- 株式報酬は別の取扱いが必要。 外国の親会社が日本子会社の従業員に付与する株式やストックオプションは、通常、給与計算を通じて源泉徴収されませんが、子会社は税務署に報告する必要があり、従業員は一般に確定申告をします。
- 居住者区分で税率が変わる。 海外赴任などで年の途中に非居住者となった従業員は、国内源泉の給与について一律の税率に切り替わります。
- 納付の遅れにはペナルティがある。 源泉徴収税の納付が遅れると、最終的に従業員の税額が正しくても、不納付加算税と延滞税が課されます。
出典
- 所得税法第183条、第212条および第226条。
- 東日本大震災からの復興のための施策を実施するために必要な財源の確保に関する特別措置法（復興特別所得税）、令和8年度税制改正による改正（2027年1月から1.1%と防衛特別所得税1%、復興特別所得税は2047年まで）。
- 国税庁、源泉徴収税額表。